青海地處三江源頭，地理、氣候條件獨特，孕育了諸多適應高原特殊自然環境的水生生物物種，維系了高原水體生態環境，是重要的生物資源和基因庫。青海省分布的各類水生生物中，魚類分屬3目5科18屬52種，主要以裂腹魚亞科和條鰍亞科為主，且多數種類為我國特有的高原珍稀物種。按省內魚類區系分布，長江水系21種、黃河水系23種，瀾滄江水系8種，另外在內陸水系分布中柴達木水系10種、青海湖水系6種、可可西裡水系6種、湟水河水系13種、黑河水系6種。水生獸類3種、兩棲類10種、省內水生維管束植物59種。

目前，青海省已建立14處國家級水產種質資源保護區，保護面積258.32萬平方米 ，其中核心區面積156.27平方米，保護珍稀瀕危土著魚類30余種。

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