青海地处三江源头，地理、气候条件独特，孕育了诸多适应高原特殊自然环境的水生生物物种，维系了高原水体生态环境，是重要的生物资源和基因库。青海省分布的各类水生生物中，鱼类分属3目5科18属52种，主要以裂腹鱼亚科和条鳅亚科为主，且多数种类为我国特有的高原珍稀物种。按省内鱼类区系分布，长江水系21种、黄河水系23种，澜沧江水系8种，另外在内陆水系分布中柴达木水系10种、青海湖水系6种、可可西里水系6种、湟水河水系13种、黑河水系6种。水生兽类3种、两栖类10种、省内水生维管束植物59种。

目前，青海省已建立14处国家级水产种质资源保护区，保护面积258.32万平方米 ，其中核心区面积156.27平方米，保护珍稀濒危土著鱼类30余种。

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